Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms