Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2Q96Q42 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2Q96Q42 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms