Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms