Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NSMCE2Q96MF7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms