Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC17Q96LX7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC17Q96LX7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms