Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms