Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC124Q96CT7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC124Q96CT7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms