Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD2Q96BF3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms