Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms