Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RFKQ969G6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFKQ969G6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms