Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms