Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms