Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms