Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC4Q8WW27 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms