Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms