Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms