Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms