Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms