Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AVL9Q8NBF6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AVL9Q8NBF6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms