Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNBD1Q8NA66 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms