Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms