Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms