Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms