Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CHCHD4Q8N4Q1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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