Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms