Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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