Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms