Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LETMD1Q6P1Q0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms