Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL5Q6EMB2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTLL5Q6EMB2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms