Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 999 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCTP1Q6DN14 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCTP1Q6DN14 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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