Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms