Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNT1Q5JUK3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms