Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC178Q5BJE1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms