Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms