Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms