Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms