Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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GEN1Q17RS7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GEN1Q17RS7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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