Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms