Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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