Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HIST2H2BEQ16778 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST2H2BEQ16778 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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