Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms