Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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