Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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