Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASIC2Q16515 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms