Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms