Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA4Q16363 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA4Q16363 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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