Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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