Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETFDHQ16134 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFDHQ16134 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms