Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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