Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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